ABSTRACT
ABSTRACT Objective. To evaluate the intrapopulation genetic variation of A. fulica in the Valle del Cauca. Materials and methods. Ten microsatellite loci from specimens collected at eight municipalities in the Valle del Cauca Department were amplified. Allelic frequencies and descriptors of intrapopulation genetic diversity were estimated. Bayesian analysis was used to estimate the number of groups present in the study area. Results. Two groups were identified in the Valle del Cauca (p > 50%): one group comprised individuals from the north and center of the department, and one group comprised individuals from the south and west of the department. These groups were genetically different from each other (FST 0.16; p<0.05). Isolation by distance was confirmed (Mantel p 0.01; R2 0.06), and a high level of endogamy was detected through a deficit of heterozygotes in the evaluated loci (FIS 0.45). Conclusions. We suggest that the A. fulica population present in the Valle del Cauca could have been introduced at more than one location, or that there could have been more than one wave of invasion. The high level of endogamy is probably the result of control activities that eliminated adult individuals in the population, which has led to an enhanced founder effect.
RESUMEN Objetivo. Evaluar la variación genética intrapoblacional de A. fulica en el Valle del Cauca. Materiales y métodos. Se amplificaron diez loci microsatélites de muestras obtenidas en ocho municipios del Departamento. Se estimaron las frecuencias alélicas y descriptores de la diversidad genética intrapoblacional y se discriminó mediante un análisis bayesiano la cantidad de agrupaciones presentes en la zona de estudio. Resultados. Se identificaron dos agrupaciones en el Valle del Cauca (p>50%): una conformada por los individuos de los municipios del Norte y Centro, otra por los municipios del Sur y Occidente. Estas agrupaciones, fueron genéticamente diferentes (FST0.16; p<0.05), confirmándose además aislamiento por distancia (Mantel p 0.01; R20.06) y un alto nivel de endogamia a partir del déficit de heterocigotos en los loci evaluados (FIS0.45). Conclusiones. Se sugiere que la población de A. fúlica en el Valle del Cauca pudo tener más de un lugar de introducción o incluso más de una oleada de invasión. Además, el alto nivel de endogamia probablemente es el resultado de las actividades de control, las cuales eliminan individuos adultos de la población lo que conlleva al incremento de la deriva per se del efecto fundador.
ABSTRACT
Los marcadores genéticos del pelaje y malformaciones óseas han permitido caracterizar el perfil genético de más de 400 poblaciones del gato doméstico alrededor del mundo. Hace 15 años se estableció dicho perfil en la ciudad de Cali (Colombia). En este estudio se determinó si el norte y sur de Cali se comportan como subpoblaciones y se comparó el perfil total con el estudio pasado. Se encontró una disminución de la frecuencia alélica de a (no-agouti) y d (dilution), pero un aumento en cinco, especialmente en l (longhair) y c s (siamese). Dichas diferencias pueden atribuirse a la selección humana de características más atractivas y por el flujo génico resultante del crecimiento demográfico de la ciudad, lo que explicaría también el primer reporte de los alelos inhibitor y ticked abyssinian. Se evaluó el equilibrio Hardy-Weinberg para el norte, sur y las dos zonas juntas, usando los loci white spotting y orange, encontrándose desequilibrio en este último para las tres zonas evaluadas debido a un déficit de heterocigotos. Norte y sur se dividieron en dos, y cada sub-muestra presentó equilibrio Hardy-Weinberg, aunque las diferencias en las frecuencias alélicas y heterocigosidades resaltaron microestructura geográfica y una relación entre tiempo de fundación del barrio y heterocigosidad. Norte y sur resultaron ser una población y no subpoblaciones (F ST= 0,0004, D= 0,0017), al igual que las nueve poblaciones colombianas con las que se comparó la presente ciudad. Se sugiere realizar un análisis microgeográfico de flujo génico y la definición de posibles colonias de gatos en Cali.
The coat genetic markers and skeleton abnormalities have allowed characterize the profile from more than 400 domestic cat populations around the world. 15 years ago, that profile was established in the city of Cali (Colombia). In this study it was determined if north and south of the city are subpopulations and it was compared the total profile against past study. A decrease in allele frequency of a (non-agouti) and d (dilution) was found, but an increase of five alleles was found, especially in l (long hair) and c s (siamese). These differences could be attributed to human selection of more attractive characteristics and gene flow resulting from demographic growth city, which would also explain the first report of inhibitor and ticked abyssinian alleles. Hardy-Weinberg equilibrium was evaluated for the north, south and both areas together, using white spotting and orange loci, determining disequilibrium in orange for the three evaluated areas due to a heterozygotes deficit. North and south were divided into two, each sub-sample showed Hardy-Weinberg equilibrium, although allele frequencies and heterozygosities highlighted microgeographic structure and a relationship between founding time of the neighborhood and heterozygosity. North and south are a single population and aren´t subpopulations (F ST= 0,0004, D= 0,0017), as well as nine Colombian populations with which this city was compared. It is suggested to make a microgeographical gene flow analysis and the definition of possible cat colonies in Cali.